根据发表在《科学》期刊上的一项研究，当尼安德特人与远古现代人发生杂交时，配对双方大多是尼安德特人男性与现代人女性。这一发现有助于解释存在于大多数现代人体内的尼安德特人血统为何分布不均。尼安德特人基因含量异常稀少的现象在 X 染色体上尤为明显。这种现象有两种解释：要么是 X 染色体上的尼安德特人的基因变异对现代人不利，导致因自然选择而逐渐淘汰；或是早期的杂交主要发生在男性尼安德特人与女性现代人之间，导致极少的尼安德特人的 X 染色体 DNA 进入现代人的基因库。研究人员追溯了古代基因的流动模式，揭示尼安德特人 X 染色体中的现代人血统的相对过剩量达 62%，表明杂交主要发生在男性尼安德特人与女性现代人之间。
